Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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TOP3AQ13472 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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