Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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