Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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