Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SRSF5Q13243 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms