Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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FOXC1Q12948 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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FOXC1Q12948 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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FOXC1Q12948 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXC1Q12948 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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