Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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