Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPREP23469 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPREP23469 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPREP23469 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPREP23469 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPREP23469 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPREP23469 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPREP23469 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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