Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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USP35Q9P2H5 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP35Q9P2H5 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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