Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CSPP1Q1MSJ5 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms