Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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