Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CCDC85BQ15834 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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