Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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SIX1Q15475 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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