Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
R3HDM1Q15032 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
R3HDM1Q15032 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms