Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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SP140Q13342 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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SP140Q13342 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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SP140Q13342 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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SP140Q13342 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
SP140Q13342 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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