Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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