Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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IFT88Q13099 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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IFT88Q13099 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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IFT88Q13099 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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IFT88Q13099 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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IFT88Q13099 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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