Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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BPTFQ12830 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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BPTFQ12830 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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BPTFQ12830 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BPTFQ12830 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BPTFQ12830 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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