Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149 ms