Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ACTBP60709 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ACTBP60709 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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