Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPRMP28827 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPRMP28827 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPRMP28827 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPRMP28827 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPRMP28827 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PTPRMP28827 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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PTPRMP28827 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRMP28827 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRMP28827 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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