Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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PTPRBP23467 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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PTPRBP23467 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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