Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CEP290O15078 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CEP290O15078 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CEP290O15078 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CEP290O15078 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CEP290O15078 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CEP290O15078 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CEP290O15078 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CEP290O15078 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CEP290O15078 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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CEP290O15078 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CEP290O15078 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CEP290O15078 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CEP290O15078 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CEP290O15078 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CEP290O15078 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CEP290O15078 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CEP290O15078 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CEP290O15078 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CEP290O15078 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CEP290O15078 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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