Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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