Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BEST4Q8NFU0 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms