Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL24A1Q17RW2 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms