Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NDUFA9Q16795 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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NDUFA9Q16795 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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NDUFA9Q16795 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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NDUFA9Q16795 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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