Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CTF1Q16619 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms