Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TAF1AQ15573 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms