Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms