Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCIRG1Q13488 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms