Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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