Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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PTPN13Q12923 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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