Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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BPTFQ12830 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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