Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.8 ms