Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RN7SL869P-201ENST00000497032 300 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 TPD52-202ENST00000379097 2563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CACNB1Q02641 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms