Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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