Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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HOXA2O43364 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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HOXA2O43364 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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HOXA2O43364 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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HOXA2O43364 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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HOXA2O43364 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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HOXA2O43364 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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HOXA2O43364 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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