Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTF1Q16619 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms