Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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