Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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