Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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