| RUNX2 | Q13950 | DLD-204 | ENST00000437604 | 1859 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF107-203 | ENST00000395391 | 6094 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF734P-201 | ENST00000419494 | 1534 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DTHD1-205 | ENST00000507598 | 2606 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | STON1-GTF2A1L-203 | ENST00000402114 | 3790 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR9H1P-201 | ENST00000446393 | 4888 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RIMS1-206 | ENST00000425662 | 2799 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC17A1-204 | ENST00000476801 | 1704 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CEP295-201 | ENST00000325212 | 8057 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CFAP70-203 | ENST00000355577 | 3691 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLET1-201 | ENST00000338832 | 1215 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.18-201 | ENST00000362461 | 102 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-660P-201 | ENST00000364566 | 109 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP509-201 | ENST00000364577 | 119 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD116-9-201 | ENST00000384000 | 95 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-356P-201 | ENST00000384140 | 107 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD116-3-201 | ENST00000384287 | 95 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD116-7-201 | ENST00000384404 | 95 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD116-5-201 | ENST00000384462 | 95 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR141-201 | ENST00000384975 | 95 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP372-201 | ENST00000390836 | 115 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD66.1-201 | ENST00000391230 | 76 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL121972.1-201 | ENST00000402023 | 252 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009237.10-201 | ENST00000414112 | 510 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPATA17-AS1-201 | ENST00000415765 | 420 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OFD1P11Y-201 | ENST00000418213 | 1177 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS12P5-201 | ENST00000423449 | 371 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL18P10-201 | ENST00000425606 | 538 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC131571.1-201 | ENST00000429821 | 577 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZYG11AP1-201 | ENST00000430329 | 837 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCNB1IP1P2-201 | ENST00000432876 | 818 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01884-201 | ENST00000433429 | 440 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL117351.1-201 | ENST00000438864 | 766 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CBX1P1-201 | ENST00000440184 | 427 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL157359.2-201 | ENST00000440372 | 784 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01004-201 | ENST00000445184 | 686 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590399.6-201 | ENST00000446396 | 307 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009220.1-201 | ENST00000451614 | 275 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL603839.1-201 | ENST00000453437 | 432 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00894-208 | ENST00000455777 | 284 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ASH1L-IT1-201 | ENST00000458371 | 448 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-136P-201 | ENST00000458819 | 69 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL41P-201 | ENST00000476144 | 297 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS6P4-201 | ENST00000494693 | 758 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC034234.1-201 | ENST00000502993 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008802.1-201 | ENST00000519121 | 791 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009643.1-201 | ENST00000532030 | 391 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL352979.3-201 | ENST00000553515 | 247 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PSMB7P1-201 | ENST00000556349 | 514 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01899-201 | ENST00000580323 | 312 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAGOH2P-202 | ENST00000584384 | 429 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELOCP28-201 | ENST00000590044 | 317 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DUXAP11-201 | ENST00000603858 | 526 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL009028.1-201 | ENST00000604895 | 802 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107031.1-201 | ENST00000604939 | 347 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00649-214 | ENST00000609132 | 668 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL138721.1-201 | ENST00000616756 | 179 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007546.1-201 | ENST00000619452 | 559 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091931.1-201 | ENST00000623488 | 728 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011944.2-201 | ENST00000624440 | 683 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FLG-AS1-207 | ENST00000628475 | 497 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5T1-201 | ENST00000641368 | 1118 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZRANB3-201 | ENST00000264159 | 4046 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADGRL3-203 | ENST00000506700 | 4838 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTRNR2L13-201 | ENST00000604093 | 1445 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR8J3-203 | ENST00000641913 | 3047 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PREPL-205 | ENST00000409411 | 4725 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELL2P3-201 | ENST00000457883 | 1602 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR10D3-202 | ENST00000641351 | 3561 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRUNE2-208 | ENST00000443509 | 12356 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024940.1-206 | ENST00000632817 | 4299 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C1D-201 | ENST00000355848 | 2233 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BCAP29-203 | ENST00000379119 | 5773 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EMSY-215 | ENST00000533248 | 3798 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CREM-201 | ENST00000337656 | 900 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CD80-202 | ENST00000383669 | 771 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPRR2A-201 | ENST00000392653 | 709 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1250-201 | ENST00000408098 | 113 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAB28P1-201 | ENST00000411517 | 641 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P108-201 | ENST00000413857 | 481 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP39-201 | ENST00000415533 | 405 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P30-201 | ENST00000420888 | 709 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005517.2-201 | ENST00000424673 | 553 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RWDD4P2-201 | ENST00000426392 | 563 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MYCBP2-AS2-201 | ENST00000428716 | 428 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139824.1-201 | ENST00000431983 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL512271.1-201 | ENST00000439878 | 434 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GACAT1-202 | ENST00000441383 | 540 nt | TSL 4 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL035701.1-201 | ENST00000444038 | 462 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010884.1-201 | ENST00000456519 | 642 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P1-201 | ENST00000468161 | 747 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P9-201 | ENST00000468715 | 747 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C10orf128-207 | ENST00000474718 | 614 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC072039.1-201 | ENST00000477611 | 581 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093267.1-201 | ENST00000489176 | 961 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5H5P-201 | ENST00000503164 | 928 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC114981.1-201 | ENST00000503897 | 678 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097478.1-202 | ENST00000508021 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGKV1OR2-1-201 | ENST00000514060 | 354 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC117532.1-201 | ENST00000514638 | 323 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |