Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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