Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms