Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CENPFP49454 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CENPFP49454 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CENPFP49454 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CENPFP49454 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CENPFP49454 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CENPFP49454 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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CENPFP49454 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CENPFP49454 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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