Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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