Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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