Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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