Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
USP34Q70CQ2 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP34Q70CQ2 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms