Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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CCDC96Q2M329 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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CCDC96Q2M329 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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CCDC96Q2M329 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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CCDC96Q2M329 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC96Q2M329 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC96Q2M329 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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